研究人員在后顱窩組A (PFA)室管膜瘤的基因組中發現了獨特的三維特征TULIPs，這是一種難以治療的腦腫瘤，在非常年幼的兒童中被診斷出來。這一發現由貝勒醫學院、德克薩斯兒童醫院、麥吉爾大學和合作機構的一組研究人員發表在《細胞》雜志上，可能會導致新療法的發展。

“PFA室管膜瘤是致命的。放射治療是目前唯一可用的治療方法，不能治愈，而且會導致嚴重的發育和認知問題。PFA的有效治療進展甚微的原因之一是，大多數這些腫瘤缺乏驅動其生長的明確基因突變。由于沒有明確的治療目標，我們無法設計特定的治療方法，我們采取了另一種方法，研究了細胞核內的DNA包裝。”貝勒和德克薩斯兒童醫院的兒科、血液腫瘤學副教授Marco Gallo博士說。

身體中的每個細胞都有大約6.6英尺(2米)的線性DNA，這些DNA儲存在細胞核中，使細胞能夠輕松地訪問最常用的基因，同時將不常用的基因放在一邊。這就像組織一個衣櫥，把最常用的衣服放在前面，很少穿的放在后面。為了適應微小的細胞核，長DNA分子被折疊、扭曲和環化，從而形成特定的3D構象，有些更緊密，有些更放松，最終可以幫助細胞表達完成其工作所需的基因。

關于兒童腦腫瘤細胞如何以3D方式組織其基因組，我們所知甚少。“在這項研究中，我們使用high - c技術來描繪兒科PFA室管膜瘤全基因組的3D結構，并將它們與不同腫瘤類型和非惡性組織的基因組進行比較，”該研究的共同資深作者、貝勒和德克薩斯兒童醫院的兒科、血液學、腫瘤學和神經外科教授Michael D. Taylor博士說。

“我們發現PFA室管膜瘤特異性3D基因組特征在可預測的基因組位置復發。有趣的是，這些特征在其他類型的兒童腦癌中并不存在。我們稱它們為TULIPs，代表pfa中的B型超長相互作用。”

TULIPs 是DNA非常緊密的特定區域，因此很難進入，這表明細胞可能不經常使用該區域的基因。“TULIPs 也傾向于在很長的距離上相互作用。染色體兩端的TULIPs 可以找到以驚人的力量相互作用的方法，不同染色體上的TULIPs 也可以收斂并相互作用。我們還發現，TULIPs 外區域的DNA看起來更放松。這很重要，因為TULIPs 與細胞的功能有關。”

TULIPs 攜帶一個化學標簽，特別是組蛋白H3K9上的一個甲基，這是一種與DNA相關的蛋白質。Gallo說:“我們發現抑制PFA患者源培養物中H3K9的標記導致TULIPs之間的相互作用減弱，PFA室管膜瘤細胞存活率總體下降。”“總的來說，我們的數據表明，TULIPs在PFA細胞的三維核空間中的聚集取決于甲基化H3K9組蛋白水平的維持，并且TULIP的相互作用對PFA細胞活力很重要，為治療開辟了新的潛在場所。”

“TULIPs 介導癌癥行為的機制尚不完全清楚。我們的目標是進一步研究TULIPs如何產生并影響PFA室管膜瘤的發展。TULIPs 在這些高風險腫瘤中的獨特性促使我們研究針對它們的治療策略，以促進腫瘤的消除。”


（文章來源：www.ebiotrade.com/newsf/2024-7/20240711050133877.htm）